中科院昆明动物所开发出精神分裂症遗传研究数据库

 

近日，中国科学院昆明动物研究所罗雄剑课题组和姚永刚课题组开展合作，开发构建了精神分裂症的遗传数据库SZDB。该研究成果发表于《精神分裂症通报》。

精神分裂症的病因目前仍不清楚，然而遗传因素和环境因素在精神分裂症发生中发挥重要作用。科研人员开发构建的精神分裂症遗传数据库SZDB收集了众多与精神分裂症相关的数据，包括遗传研究数据、基因表达数据、网络数据、大脑eQTL数据以及SNP功能注释数据等。通过对这些不同层面的数据进行整合和分析，可鉴别到一些重要的精神分裂症候选基因。

SZDB主要包括3大模块：（1）搜索模块，该模块主要进行一些常规检索工作，例如SNP的检索和基因检索；（2）分析和工具模块，该模块能实现一些分析功能，如共表达分析、蛋白相互作用网络分析、eQTL分析等；（3）基因模块，该模块收录了各种与精神分裂症相关的数据，包含GWAS数据、拷贝数变异数据、连锁分析数据等。与领域中已有的数据库不同，SZDB引入个性化分析模块（Analysis & Tools），用户可以通过该模块做一些个性化分析（如eQTL、蛋白相互作用、共表达等）。

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